優點
＊使農作物更適應不利的生長環境,例如適乾旱
＊解決糧食短缺問題。
＊ 增加蟲害抵抗力，從而減少使用除害劑，避免環境污染。
＊ 改良食物外觀、味道和口感，增加食物種類，提升食物品質。
＊ 改變農作物特性,更易於加工
＊ 除去食物中可能過敏的成分，增加食物營養，提高附加價值。
缺點
＊ 可能對蝴蝶等昆蟲造成傷害。
＊ 可能影響周邊的植物的生長。
＊ 生產外來蛋白可能產生的毒性
＊ 抗抗生素基因的存在
＊ 品質的不確定性
＊ 抗殺草劑基因及抗蟲基因可能造成外來基因擴散
＊ 抗抗生素基因可能造成基因水平轉移
＊ 國際貿易之利益問題法
＊ 可能昆蟲或病菌在演化中增加抵抗力，或產生新的
物種，之後一樣有可能會傷害作物。法律與道德問題
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